醫藥用純化水設備的維護保養非常重要，正確的維護保養是延長設備使用壽命以及產水水質的保障。根據生產計劃安排或者遇到節假日時，醫藥用純化水設備應注意做好停機維護，以免影響設備后續的使用。
當純化水設備存放周期超過30天以上時，可將反滲透膜元件取出單獨用保護劑保存，而如果是短期停機維護時，反滲透膜殼仍然安裝在壓力容器內，需要注意以下保存步驟：

1、首先需要對系統進行化學清洗，盡可能將系統內污染物清除，以便系統的長期保存。

2、其次，需要對系統進行殺菌消毒。使用系統產水配置殺菌劑，并不斷地在系統內循環沖洗系統，將系統內的微生物、藻類物質等殺滅。

3、當系統內殺菌劑充滿后，關閉進水和水泵，確認系統處于*充滿的狀態，這樣就可以防止污染物進入，實現對系統的有效保護。

4、當溫度在27℃以下時，每間隔30天需要使用新配置的殺菌劑，重復以上第二步、第三步操作。如果溫度高于27℃，每間隔15天更換殺菌劑，并重復以上的第二、第三步驟。

5、在醫藥用純化水設備重新運行前，需要對設備低壓沖洗1小時，然后再高壓沖洗10分鐘。注意，無論是低壓沖洗還是高壓沖洗，應始終保持廢水排放閥處于打開狀態。在設備運行后，需要檢查并確認產水側不含有任何殺菌劑和保護液。